เมื่อขรัวโตทราบข่าวท่านจึงตัดสินใจเดินทางเข้าวังหลวงและรัชกาลที่ 4 ท่านทรงแต่งตั้งเป็น พระธรรมปิติ เป็นเจ้าอาวาส วัดระฆังฯ ตั้งแต่นั้นเป็นต้นมาและท่านยังทรงเป็นที่ปรึกษาทางด้านการเมืองการปกครองหลายๆอย่าง ...
หลังจากท่านได้รับตำแหน่งเจ้าอาวาสวัดระฆังฯแล้ว ท่าน (สมเด็จพุฒาจารย์ โต พรหมรังสี) และ ท่าน (เจ้ากรมพระราชวังบวรวิไชชาญ) ท่านได้ปรึกษาหารือจะทำการสร้างเจดีย์ขึ้น ที่หลังอุโบสถวัดบวรสถานสุทธาวาส วัดพระแก้ว (วังหน้า) เพื่อบรรจุพระธาตุ ที่ท่านสมเด็จฯ ได้พบตามเจดีย์เก่าที่ผุพังและได้เก็บสะสมไว้ ให้ได้บรรจุเจดีย์ดังเดิม ...จึงอยากให้สร้างเจดีย์ขึ้น...ราวปี 2400 และได้มีการสร้างพระพุทธพิมพ์มากมายเพื่อบรรจุลงไปด้วย จึงได้ระดมช่าง 10 หมู่ช่วยกันสร้างและแกะแม่พิมพ์...และช่างอีกส่วนก็ทำการสร้างเจดีย์ขึ้นเพื่อบรรจุพ ระธาตุ ตามความประสงค์ ของ (องค์สมเด็จพุฒาจารย์ โต พรหมรังสี)
การสร้างพระในครั้งนั้น (สมเด็จพระพุฒาจารย์ โต พรหมรังสี) ท่านได้นำพระธาตุ และ ลูกปัดโบราณ และผงเก่าพระพุทธรูปที่ชำรุด ผงทอง วัตถุมงคลต่างๆ บางส่วนที่ท่านได้พบและสมสมไว้ เช่น แร่เหล็กไหล พระนาคปรก และพระอรหันตธาตุ ฝังและผสมลงไปในเนื้อพระ
และยังมีการนำพระที่ทางวังหน้าได้สร้างไว้มาร่วมบรรจุในเจดีย์อีกด้วย....!
พระบรมสารีริกธาตุ และพระอรหันตธาตุ อีกจำนวนมากที่ได้จากสถานที่ต่างๆอีกจำนวนหนึ่ง จึงนำใสโถแก้วลงรักปิดทองอย่างดีแล้วนำบรรจุไว้ที่เจเดย์พระธาตุ ที่สร้างขึ้น....
ส่วนพระของวังหน้า ที่จะนำมาทำการบรรจุลงไปด้วยก็จะทำการนำแผ่นทองคำมาปั๊ม คำว่า (ขรัวโต พระธาตุ) เพื่อให้ทราบว่าจะนำไปบรรจุที่เจดีย์พระธาตุ และยังเป็นที่ระลึกของการสร้างเจดีย์พระธาตุ อีกด้วย
การก่อสร้างใช้เวลาประมาณ 2 ปี จึงแล้วเสร็จ
เจดีย์พระธาตุพนมจำลอง
วัดบวรสถานสุทธาวาส (วังหน้า)
